Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN4AP35499 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN4AP35499 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms