Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFC1P35251 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFC1P35251 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFC1P35251 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFC1P35251 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFC1P35251 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFC1P35251 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFC1P35251 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFC1P35251 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFC1P35251 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFC1P35251 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFC1P35251 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFC1P35251 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFC1P35251 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFC1P35251 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFC1P35251 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFC1P35251 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFC1P35251 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFC1P35251 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFC1P35251 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFC1P35251 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFC1P35251 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC1P35251 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC1P35251 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC1P35251 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC1P35251 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC1P35251 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC1P35251 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC1P35251 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC1P35251 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC1P35251 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC1P35251 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC1P35251 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC1P35251 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC1P35251 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC1P35251 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC1P35251 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC1P35251 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC1P35251 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC1P35251 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC1P35251 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC1P35251 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC1P35251 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC1P35251 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC1P35251 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC1P35251 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC1P35251 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC1P35251 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC1P35251 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC1P35251 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC1P35251 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC1P35251 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC1P35251 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC1P35251 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC1P35251 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC1P35251 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC1P35251 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC1P35251 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC1P35251 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC1P35251 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC1P35251 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC1P35251 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC1P35251 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC1P35251 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC1P35251 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC1P35251 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC1P35251 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC1P35251 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC1P35251 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC1P35251 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC1P35251 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC1P35251 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC1P35251 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC1P35251 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC1P35251 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC1P35251 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC1P35251 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC1P35251 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC1P35251 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC1P35251 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC1P35251 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC1P35251 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC1P35251 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC1P35251 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC1P35251 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC1P35251 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC1P35251 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC1P35251 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFC1P35251 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFC1P35251 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFC1P35251 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFC1P35251 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFC1P35251 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFC1P35251 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFC1P35251 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RFC1P35251 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFC1P35251 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFC1P35251 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFC1P35251 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFC1P35251 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms