Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP1P32455 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP1P32455 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP1P32455 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP1P32455 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP1P32455 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP1P32455 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP1P32455 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP1P32455 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP1P32455 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP1P32455 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP1P32455 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP1P32455 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP1P32455 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP1P32455 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP1P32455 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP1P32455 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP1P32455 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP1P32455 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP1P32455 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP1P32455 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP1P32455 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP1P32455 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP1P32455 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP1P32455 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP1P32455 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP1P32455 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP1P32455 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP1P32455 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP1P32455 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP1P32455 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP1P32455 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP1P32455 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP1P32455 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP1P32455 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP1P32455 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP1P32455 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP1P32455 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP1P32455 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP1P32455 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP1P32455 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP1P32455 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP1P32455 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP1P32455 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP1P32455 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP1P32455 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP1P32455 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP1P32455 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP1P32455 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP1P32455 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP1P32455 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP1P32455 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP1P32455 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP1P32455 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP1P32455 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP1P32455 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP1P32455 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP1P32455 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP1P32455 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP1P32455 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP1P32455 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP1P32455 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP1P32455 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP1P32455 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP1P32455 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP1P32455 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP1P32455 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP1P32455 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP1P32455 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP1P32455 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP1P32455 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP1P32455 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP1P32455 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP1P32455 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP1P32455 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP1P32455 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP1P32455 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP1P32455 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP1P32455 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP1P32455 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP1P32455 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP1P32455 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP1P32455 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP1P32455 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBP1P32455 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBP1P32455 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBP1P32455 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP1P32455 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP1P32455 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP1P32455 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP1P32455 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP1P32455 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP1P32455 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP1P32455 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP1P32455 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP1P32455 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP1P32455 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP1P32455 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP1P32455 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP1P32455 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms