Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA3P32297 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms