Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
L1CAMP32004 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms