Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM5AP29375 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5AP29375 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5AP29375 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms