Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHB2P29323 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB2P29323 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms