Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTR2AP28223 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HTR2AP28223 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HTR2AP28223 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HTR2AP28223 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms