Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSSP25774 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSSP25774 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSSP25774 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSSP25774 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSSP25774 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSSP25774 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSSP25774 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSSP25774 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSSP25774 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSSP25774 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSSP25774 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSSP25774 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSSP25774 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSSP25774 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSSP25774 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSSP25774 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSSP25774 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSSP25774 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSSP25774 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSSP25774 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSSP25774 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSSP25774 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSSP25774 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSSP25774 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSSP25774 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSSP25774 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSSP25774 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSSP25774 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSSP25774 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSSP25774 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSSP25774 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSSP25774 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSSP25774 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSSP25774 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSSP25774 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSSP25774 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSSP25774 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSSP25774 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSSP25774 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSSP25774 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSSP25774 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSSP25774 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSSP25774 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSSP25774 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSSP25774 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSSP25774 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSSP25774 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSSP25774 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSSP25774 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSSP25774 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSSP25774 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSSP25774 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSSP25774 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSSP25774 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSSP25774 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSSP25774 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSSP25774 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSSP25774 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSSP25774 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSSP25774 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSSP25774 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSSP25774 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSSP25774 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSSP25774 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSSP25774 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSSP25774 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSSP25774 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSSP25774 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSSP25774 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSSP25774 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSSP25774 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSSP25774 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSSP25774 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSSP25774 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSSP25774 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSSP25774 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSSP25774 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSSP25774 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSSP25774 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSSP25774 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSSP25774 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSSP25774 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSSP25774 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSSP25774 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSSP25774 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSSP25774 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTSSP25774 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTSSP25774 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTSSP25774 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTSSP25774 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTSSP25774 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTSSP25774 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTSSP25774 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTSSP25774 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTSSP25774 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTSSP25774 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTSSP25774 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTSSP25774 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTSSP25774 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms