Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GADD45AP24522 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms