Protein–RNA interactions for Protein: P24298

GPT, Alanine aminotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPTP24298 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPTP24298 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPTP24298 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPTP24298 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPTP24298 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPTP24298 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPTP24298 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPTP24298 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPTP24298 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPTP24298 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPTP24298 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPTP24298 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPTP24298 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPTP24298 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPTP24298 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GPTP24298 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GPTP24298 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPTP24298 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GPTP24298 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GPTP24298 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPTP24298 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GPTP24298 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPTP24298 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPTP24298 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPTP24298 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPTP24298 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPTP24298 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPTP24298 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPTP24298 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPTP24298 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPTP24298 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPTP24298 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPTP24298 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPTP24298 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GPTP24298 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPTP24298 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPTP24298 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPTP24298 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPTP24298 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GPTP24298 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPTP24298 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPTP24298 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPTP24298 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPTP24298 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPTP24298 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPTP24298 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPTP24298 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPTP24298 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPTP24298 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
GPTP24298 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPTP24298 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPTP24298 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GPTP24298 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GPTP24298 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPTP24298 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPTP24298 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPTP24298 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPTP24298 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GPTP24298 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GPTP24298 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GPTP24298 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GPTP24298 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPTP24298 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPTP24298 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPTP24298 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPTP24298 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPTP24298 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GPTP24298 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPTP24298 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPTP24298 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPTP24298 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPTP24298 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPTP24298 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms