Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACO1P21399 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACO1P21399 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACO1P21399 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACO1P21399 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACO1P21399 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACO1P21399 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACO1P21399 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACO1P21399 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACO1P21399 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACO1P21399 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACO1P21399 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACO1P21399 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACO1P21399 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACO1P21399 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACO1P21399 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACO1P21399 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACO1P21399 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACO1P21399 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACO1P21399 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACO1P21399 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACO1P21399 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACO1P21399 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACO1P21399 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACO1P21399 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACO1P21399 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACO1P21399 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACO1P21399 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACO1P21399 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACO1P21399 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACO1P21399 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACO1P21399 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACO1P21399 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACO1P21399 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ACO1P21399 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACO1P21399 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACO1P21399 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACO1P21399 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACO1P21399 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACO1P21399 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACO1P21399 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACO1P21399 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACO1P21399 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACO1P21399 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACO1P21399 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACO1P21399 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACO1P21399 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ACO1P21399 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACO1P21399 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACO1P21399 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACO1P21399 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACO1P21399 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACO1P21399 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACO1P21399 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACO1P21399 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACO1P21399 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACO1P21399 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACO1P21399 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACO1P21399 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACO1P21399 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACO1P21399 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACO1P21399 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACO1P21399 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACO1P21399 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACO1P21399 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACO1P21399 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACO1P21399 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACO1P21399 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACO1P21399 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACO1P21399 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACO1P21399 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACO1P21399 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACO1P21399 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms