Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB1P20618 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB1P20618 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms