Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms