Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B1P20020 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms