Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms