Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VCAM1P19320 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms