Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT15P19012 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT15P19012 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT15P19012 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT15P19012 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT15P19012 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT15P19012 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT15P19012 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT15P19012 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT15P19012 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT15P19012 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT15P19012 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT15P19012 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT15P19012 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT15P19012 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT15P19012 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT15P19012 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT15P19012 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT15P19012 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT15P19012 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT15P19012 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT15P19012 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT15P19012 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT15P19012 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT15P19012 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT15P19012 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT15P19012 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT15P19012 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT15P19012 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT15P19012 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT15P19012 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT15P19012 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT15P19012 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT15P19012 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT15P19012 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT15P19012 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT15P19012 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT15P19012 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT15P19012 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT15P19012 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT15P19012 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT15P19012 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT15P19012 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT15P19012 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT15P19012 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT15P19012 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT15P19012 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT15P19012 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT15P19012 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT15P19012 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT15P19012 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT15P19012 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT15P19012 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT15P19012 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT15P19012 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT15P19012 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT15P19012 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT15P19012 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT15P19012 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT15P19012 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT15P19012 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT15P19012 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT15P19012 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT15P19012 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT15P19012 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT15P19012 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT15P19012 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT15P19012 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT15P19012 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT15P19012 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT15P19012 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms