Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNB2P17787 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB2P17787 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms