Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN1P17600 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN1P17600 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYN1P17600 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYN1P17600 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYN1P17600 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN1P17600 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN1P17600 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN1P17600 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN1P17600 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN1P17600 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN1P17600 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN1P17600 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYN1P17600 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN1P17600 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN1P17600 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN1P17600 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN1P17600 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN1P17600 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN1P17600 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN1P17600 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYN1P17600 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYN1P17600 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYN1P17600 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYN1P17600 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYN1P17600 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYN1P17600 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYN1P17600 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYN1P17600 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYN1P17600 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYN1P17600 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN1P17600 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN1P17600 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN1P17600 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN1P17600 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN1P17600 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN1P17600 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN1P17600 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN1P17600 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN1P17600 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN1P17600 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN1P17600 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN1P17600 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYN1P17600 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYN1P17600 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYN1P17600 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYN1P17600 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN1P17600 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN1P17600 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN1P17600 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN1P17600 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN1P17600 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN1P17600 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN1P17600 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN1P17600 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN1P17600 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYN1P17600 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYN1P17600 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYN1P17600 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYN1P17600 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYN1P17600 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYN1P17600 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYN1P17600 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYN1P17600 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYN1P17600 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYN1P17600 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYN1P17600 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYN1P17600 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYN1P17600 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYN1P17600 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYN1P17600 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYN1P17600 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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