Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB8P17481 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms