Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJA1P17302 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJA1P17302 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJA1P17302 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA1P17302 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA1P17302 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA1P17302 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA1P17302 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA1P17302 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA1P17302 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA1P17302 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA1P17302 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA1P17302 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA1P17302 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA1P17302 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA1P17302 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA1P17302 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA1P17302 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA1P17302 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA1P17302 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA1P17302 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA1P17302 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA1P17302 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA1P17302 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA1P17302 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA1P17302 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA1P17302 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA1P17302 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA1P17302 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA1P17302 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA1P17302 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA1P17302 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA1P17302 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA1P17302 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA1P17302 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA1P17302 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA1P17302 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA1P17302 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA1P17302 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA1P17302 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA1P17302 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA1P17302 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA1P17302 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA1P17302 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA1P17302 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA1P17302 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA1P17302 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA1P17302 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA1P17302 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA1P17302 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA1P17302 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA1P17302 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA1P17302 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA1P17302 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA1P17302 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA1P17302 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA1P17302 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA1P17302 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA1P17302 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA1P17302 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA1P17302 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA1P17302 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA1P17302 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA1P17302 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA1P17302 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA1P17302 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA1P17302 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA1P17302 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA1P17302 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA1P17302 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA1P17302 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA1P17302 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA1P17302 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA1P17302 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA1P17302 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA1P17302 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA1P17302 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA1P17302 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA1P17302 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA1P17302 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA1P17302 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA1P17302 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA1P17302 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA1P17302 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA1P17302 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA1P17302 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms