Protein–RNA interactions for Protein: P16389

KCNA2, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA2P16389 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNA2P16389 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNA2P16389 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNA2P16389 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms