Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRAP16234 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRAP16234 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms