Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF3P15923 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF3P15923 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF3P15923 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF3P15923 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF3P15923 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF3P15923 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF3P15923 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF3P15923 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF3P15923 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF3P15923 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF3P15923 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF3P15923 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF3P15923 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF3P15923 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF3P15923 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF3P15923 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF3P15923 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF3P15923 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF3P15923 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF3P15923 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF3P15923 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF3P15923 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF3P15923 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF3P15923 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF3P15923 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF3P15923 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF3P15923 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF3P15923 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF3P15923 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF3P15923 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF3P15923 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF3P15923 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF3P15923 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF3P15923 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF3P15923 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF3P15923 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF3P15923 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF3P15923 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF3P15923 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF3P15923 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF3P15923 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF3P15923 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF3P15923 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF3P15923 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF3P15923 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF3P15923 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF3P15923 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF3P15923 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF3P15923 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF3P15923 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF3P15923 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF3P15923 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF3P15923 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCF3P15923 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF3P15923 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF3P15923 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF3P15923 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF3P15923 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF3P15923 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF3P15923 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF3P15923 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF3P15923 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF3P15923 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF3P15923 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF3P15923 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF3P15923 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF3P15923 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF3P15923 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF3P15923 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF3P15923 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF3P15923 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF3P15923 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF3P15923 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF3P15923 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF3P15923 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF3P15923 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF3P15923 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF3P15923 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF3P15923 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF3P15923 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms