Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV1P15498 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV1P15498 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV1P15498 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV1P15498 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV1P15498 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV1P15498 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV1P15498 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV1P15498 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV1P15498 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV1P15498 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV1P15498 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV1P15498 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV1P15498 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV1P15498 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV1P15498 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV1P15498 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAV1P15498 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV1P15498 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV1P15498 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV1P15498 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAV1P15498 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAV1P15498 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV1P15498 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV1P15498 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV1P15498 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV1P15498 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV1P15498 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV1P15498 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV1P15498 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV1P15498 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV1P15498 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAV1P15498 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
VAV1P15498 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VAV1P15498 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV1P15498 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV1P15498 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV1P15498 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV1P15498 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAV1P15498 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV1P15498 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV1P15498 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV1P15498 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV1P15498 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV1P15498 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV1P15498 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV1P15498 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV1P15498 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV1P15498 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV1P15498 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV1P15498 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAV1P15498 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAV1P15498 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAV1P15498 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAV1P15498 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAV1P15498 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV1P15498 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV1P15498 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV1P15498 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV1P15498 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV1P15498 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV1P15498 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV1P15498 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV1P15498 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV1P15498 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV1P15498 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV1P15498 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV1P15498 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV1P15498 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV1P15498 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV1P15498 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV1P15498 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV1P15498 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms