Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UCHL3P15374 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UCHL3P15374 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms