Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GSPT1P15170 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GSPT1P15170 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSPT1P15170 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms