Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC130P13994 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC130P13994 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms