Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC5A1P13866 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 957.7 ms