Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms