Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL6A2P12110 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms