Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRFP11831 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRFP11831 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRFP11831 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRFP11831 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRFP11831 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRFP11831 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFP11831 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFP11831 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFP11831 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFP11831 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFP11831 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFP11831 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFP11831 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFP11831 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFP11831 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFP11831 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFP11831 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFP11831 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFP11831 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFP11831 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFP11831 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFP11831 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFP11831 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFP11831 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFP11831 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFP11831 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRFP11831 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRFP11831 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRFP11831 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRFP11831 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRFP11831 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRFP11831 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRFP11831 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRFP11831 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRFP11831 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRFP11831 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRFP11831 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRFP11831 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRFP11831 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRFP11831 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRFP11831 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRFP11831 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRFP11831 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRFP11831 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRFP11831 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRFP11831 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRFP11831 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRFP11831 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRFP11831 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRFP11831 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRFP11831 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRFP11831 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRFP11831 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRFP11831 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRFP11831 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRFP11831 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRFP11831 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRFP11831 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRFP11831 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRFP11831 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRFP11831 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRFP11831 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRFP11831 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRFP11831 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRFP11831 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRFP11831 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRFP11831 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRFP11831 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRFP11831 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRFP11831 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRFP11831 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRFP11831 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRFP11831 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRFP11831 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRFP11831 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRFP11831 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRFP11831 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRFP11831 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRFP11831 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRFP11831 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRFP11831 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRFP11831 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRFP11831 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRFP11831 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRFP11831 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms