Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN8OSP0DMR3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN8OSP0DMR3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN8OSP0DMR3 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN8OSP0DMR3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN8OSP0DMR3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN8OSP0DMR3 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN8OSP0DMR3 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN8OSP0DMR3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN8OSP0DMR3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN8OSP0DMR3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATXN8OSP0DMR3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms