Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2BP0DMP2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms