Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2CP0DJJ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms