Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
RGPD2P0DJD1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms