Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms