Protein–RNA interactions for Protein: P0C2L3

FAM163B, Protein FAM163B, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM163BP0C2L3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM163BP0C2L3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM163BP0C2L3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM163BP0C2L3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM163BP0C2L3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM163BP0C2L3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM163BP0C2L3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM163BP0C2L3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms