Protein–RNA interactions for Protein: P0C264

SBK3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK3P0C264 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK3P0C264 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK3P0C264 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK3P0C264 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms