Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPSAP08865 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPSAP08865 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPSAP08865 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPSAP08865 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPSAP08865 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPSAP08865 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPSAP08865 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPSAP08865 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPSAP08865 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPSAP08865 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPSAP08865 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPSAP08865 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPSAP08865 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPSAP08865 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPSAP08865 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPSAP08865 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPSAP08865 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPSAP08865 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPSAP08865 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPSAP08865 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPSAP08865 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPSAP08865 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPSAP08865 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPSAP08865 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPSAP08865 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPSAP08865 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPSAP08865 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPSAP08865 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPSAP08865 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPSAP08865 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPSAP08865 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPSAP08865 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPSAP08865 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPSAP08865 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPSAP08865 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPSAP08865 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPSAP08865 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPSAP08865 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPSAP08865 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPSAP08865 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPSAP08865 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPSAP08865 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPSAP08865 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPSAP08865 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPSAP08865 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPSAP08865 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPSAP08865 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPSAP08865 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPSAP08865 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPSAP08865 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPSAP08865 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPSAP08865 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPSAP08865 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPSAP08865 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPSAP08865 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPSAP08865 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPSAP08865 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPSAP08865 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPSAP08865 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPSAP08865 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPSAP08865 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPSAP08865 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPSAP08865 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPSAP08865 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPSAP08865 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPSAP08865 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPSAP08865 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPSAP08865 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPSAP08865 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPSAP08865 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPSAP08865 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPSAP08865 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPSAP08865 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPSAP08865 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPSAP08865 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPSAP08865 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPSAP08865 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPSAP08865 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPSAP08865 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPSAP08865 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPSAP08865 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPSAP08865 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPSAP08865 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPSAP08865 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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