Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS17P08708 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS17P08708 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS17P08708 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS17P08708 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS17P08708 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS17P08708 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS17P08708 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS17P08708 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS17P08708 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS17P08708 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS17P08708 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS17P08708 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS17P08708 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS17P08708 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS17P08708 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS17P08708 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS17P08708 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS17P08708 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS17P08708 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS17P08708 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS17P08708 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS17P08708 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS17P08708 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS17P08708 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS17P08708 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS17P08708 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS17P08708 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS17P08708 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS17P08708 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS17P08708 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS17P08708 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS17P08708 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS17P08708 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS17P08708 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS17P08708 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS17P08708 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS17P08708 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS17P08708 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS17P08708 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS17P08708 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS17P08708 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS17P08708 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS17P08708 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS17P08708 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS17P08708 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS17P08708 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS17P08708 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS17P08708 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS17P08708 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS17P08708 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS17P08708 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS17P08708 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS17P08708 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS17P08708 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS17P08708 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS17P08708 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS17P08708 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS17P08708 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS17P08708 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS17P08708 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS17P08708 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS17P08708 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS17P08708 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS17P08708 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS17P08708 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS17P08708 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS17P08708 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS17P08708 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS17P08708 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS17P08708 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS17P08708 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS17P08708 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS17P08708 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS17P08708 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS17P08708 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS17P08708 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS17P08708 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS17P08708 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS17P08708 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS17P08708 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS17P08708 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS17P08708 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS17P08708 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS17P08708 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS17P08708 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS17P08708 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS17P08708 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS17P08708 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS17P08708 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS17P08708 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS17P08708 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS17P08708 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS17P08708 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS17P08708 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS17P08708 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS17P08708 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS17P08708 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS17P08708 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS17P08708 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms