Protein–RNA interactions for Protein: P08651

NFIC, Nuclear factor 1 C-type, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFICP08651 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFICP08651 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFICP08651 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFICP08651 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFICP08651 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFICP08651 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NFICP08651 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFICP08651 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFICP08651 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFICP08651 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFICP08651 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NFICP08651 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NFICP08651 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFICP08651 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFICP08651 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFICP08651 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFICP08651 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFICP08651 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFICP08651 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFICP08651 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFICP08651 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFICP08651 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFICP08651 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFICP08651 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFICP08651 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFICP08651 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFICP08651 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFICP08651 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFICP08651 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFICP08651 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFICP08651 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFICP08651 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFICP08651 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFICP08651 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFICP08651 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFICP08651 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFICP08651 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFICP08651 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFICP08651 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFICP08651 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFICP08651 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFICP08651 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFICP08651 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFICP08651 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFICP08651 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFICP08651 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFICP08651 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFICP08651 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFICP08651 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFICP08651 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFICP08651 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFICP08651 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFICP08651 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFICP08651 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFICP08651 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFICP08651 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFICP08651 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFICP08651 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFICP08651 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFICP08651 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFICP08651 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFICP08651 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFICP08651 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFICP08651 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NFICP08651 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFICP08651 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFICP08651 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFICP08651 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFICP08651 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFICP08651 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFICP08651 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFICP08651 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFICP08651 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFICP08651 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFICP08651 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFICP08651 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFICP08651 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFICP08651 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFICP08651 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFICP08651 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFICP08651 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFICP08651 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFICP08651 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFICP08651 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFICP08651 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFICP08651 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFICP08651 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFICP08651 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFICP08651 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFICP08651 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFICP08651 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFICP08651 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFICP08651 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFICP08651 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFICP08651 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFICP08651 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFICP08651 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFICP08651 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFICP08651 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFICP08651 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms