Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8BP07358 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8BP07358 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8BP07358 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8BP07358 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8BP07358 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8BP07358 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8BP07358 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8BP07358 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8BP07358 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C8BP07358 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C8BP07358 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C8BP07358 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C8BP07358 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C8BP07358 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8BP07358 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8BP07358 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8BP07358 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8BP07358 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8BP07358 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8BP07358 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8BP07358 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8BP07358 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8BP07358 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8BP07358 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C8BP07358 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8BP07358 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C8BP07358 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8BP07358 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8BP07358 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8BP07358 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8BP07358 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8BP07358 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8BP07358 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8BP07358 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8BP07358 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8BP07358 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8BP07358 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8BP07358 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8BP07358 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8BP07358 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8BP07358 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8BP07358 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8BP07358 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8BP07358 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8BP07358 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8BP07358 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8BP07358 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8BP07358 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8BP07358 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8BP07358 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8BP07358 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8BP07358 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8BP07358 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8BP07358 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8BP07358 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8BP07358 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8BP07358 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8BP07358 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8BP07358 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8BP07358 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8BP07358 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8BP07358 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8BP07358 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8BP07358 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8BP07358 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8BP07358 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8BP07358 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8BP07358 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8BP07358 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8BP07358 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms