Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGRP06401 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGRP06401 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGRP06401 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGRP06401 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGRP06401 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGRP06401 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGRP06401 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGRP06401 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGRP06401 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGRP06401 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGRP06401 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGRP06401 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGRP06401 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGRP06401 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PGRP06401 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGRP06401 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGRP06401 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGRP06401 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGRP06401 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGRP06401 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGRP06401 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGRP06401 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGRP06401 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGRP06401 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGRP06401 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGRP06401 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGRP06401 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGRP06401 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGRP06401 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGRP06401 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGRP06401 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGRP06401 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGRP06401 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGRP06401 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PGRP06401 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGRP06401 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGRP06401 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGRP06401 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGRP06401 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGRP06401 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGRP06401 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGRP06401 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGRP06401 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGRP06401 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGRP06401 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGRP06401 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGRP06401 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGRP06401 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGRP06401 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGRP06401 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGRP06401 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGRP06401 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PGRP06401 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGRP06401 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGRP06401 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PGRP06401 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGRP06401 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGRP06401 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGRP06401 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGRP06401 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGRP06401 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGRP06401 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGRP06401 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGRP06401 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGRP06401 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGRP06401 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGRP06401 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms