Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT1P04264 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT1P04264 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT1P04264 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT1P04264 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT1P04264 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT1P04264 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT1P04264 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT1P04264 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT1P04264 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT1P04264 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT1P04264 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT1P04264 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT1P04264 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT1P04264 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT1P04264 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT1P04264 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT1P04264 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT1P04264 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT1P04264 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT1P04264 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT1P04264 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT1P04264 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT1P04264 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT1P04264 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT1P04264 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT1P04264 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT1P04264 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT1P04264 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT1P04264 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT1P04264 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT1P04264 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT1P04264 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT1P04264 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT1P04264 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT1P04264 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT1P04264 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT1P04264 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT1P04264 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT1P04264 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT1P04264 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT1P04264 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT1P04264 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT1P04264 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT1P04264 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT1P04264 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT1P04264 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT1P04264 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT1P04264 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT1P04264 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT1P04264 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT1P04264 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT1P04264 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT1P04264 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT1P04264 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT1P04264 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT1P04264 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT1P04264 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT1P04264 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT1P04264 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT1P04264 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT1P04264 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT1P04264 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT1P04264 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT1P04264 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT1P04264 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT1P04264 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT1P04264 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT1P04264 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT1P04264 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT1P04264 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT1P04264 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms