Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGAP02671 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGAP02671 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGAP02671 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGAP02671 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGAP02671 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGAP02671 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGAP02671 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGAP02671 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGAP02671 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGAP02671 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGAP02671 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGAP02671 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGAP02671 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGAP02671 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGAP02671 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGAP02671 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGAP02671 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGAP02671 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGAP02671 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGAP02671 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGAP02671 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGAP02671 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGAP02671 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FGAP02671 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGAP02671 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGAP02671 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGAP02671 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGAP02671 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGAP02671 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGAP02671 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGAP02671 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGAP02671 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGAP02671 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGAP02671 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGAP02671 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FGAP02671 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGAP02671 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGAP02671 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGAP02671 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGAP02671 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGAP02671 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGAP02671 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGAP02671 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGAP02671 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGAP02671 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGAP02671 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGAP02671 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGAP02671 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FGAP02671 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGAP02671 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGAP02671 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGAP02671 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGAP02671 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGAP02671 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGAP02671 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGAP02671 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGAP02671 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGAP02671 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGAP02671 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGAP02671 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGAP02671 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGAP02671 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGAP02671 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FGAP02671 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGAP02671 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGAP02671 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGAP02671 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGAP02671 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGAP02671 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGAP02671 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGAP02671 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGAP02671 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGAP02671 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGAP02671 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGAP02671 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGAP02671 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGAP02671 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGAP02671 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGAP02671 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGAP02671 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGAP02671 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGAP02671 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGAP02671 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGAP02671 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGAP02671 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGAP02671 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGAP02671 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGAP02671 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGAP02671 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGAP02671 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FGAP02671 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGAP02671 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGAP02671 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGAP02671 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGAP02671 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGAP02671 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGAP02671 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGAP02671 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGAP02671 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms