Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC2P02655 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC2P02655 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC2P02655 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC2P02655 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC2P02655 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC2P02655 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC2P02655 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC2P02655 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC2P02655 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC2P02655 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC2P02655 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC2P02655 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC2P02655 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC2P02655 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC2P02655 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC2P02655 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC2P02655 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC2P02655 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC2P02655 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC2P02655 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC2P02655 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC2P02655 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC2P02655 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC2P02655 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC2P02655 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC2P02655 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC2P02655 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC2P02655 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC2P02655 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC2P02655 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC2P02655 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC2P02655 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC2P02655 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC2P02655 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC2P02655 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC2P02655 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC2P02655 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC2P02655 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC2P02655 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC2P02655 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC2P02655 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC2P02655 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC2P02655 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC2P02655 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC2P02655 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOC2P02655 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC2P02655 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC2P02655 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC2P02655 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC2P02655 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC2P02655 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC2P02655 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC2P02655 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC2P02655 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC2P02655 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC2P02655 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC2P02655 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC2P02655 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC2P02655 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC2P02655 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC2P02655 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC2P02655 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC2P02655 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC2P02655 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC2P02655 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC2P02655 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC2P02655 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC2P02655 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC2P02655 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC2P02655 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC2P02655 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC2P02655 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC2P02655 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC2P02655 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC2P02655 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC2P02655 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC2P02655 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC2P02655 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC2P02655 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC2P02655 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC2P02655 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC2P02655 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC2P02655 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOC2P02655 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms