Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms