Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EGFRP00533 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EGFRP00533 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EGFRP00533 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EGFRP00533 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EGFRP00533 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EGFRP00533 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EGFRP00533 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EGFRP00533 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EGFRP00533 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EGFRP00533 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EGFRP00533 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EGFRP00533 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EGFRP00533 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EGFRP00533 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EGFRP00533 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EGFRP00533 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EGFRP00533 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EGFRP00533 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EGFRP00533 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EGFRP00533 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EGFRP00533 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EGFRP00533 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EGFRP00533 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EGFRP00533 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EGFRP00533 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EGFRP00533 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EGFRP00533 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EGFRP00533 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EGFRP00533 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EGFRP00533 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EGFRP00533 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EGFRP00533 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EGFRP00533 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EGFRP00533 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EGFRP00533 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EGFRP00533 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EGFRP00533 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EGFRP00533 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EGFRP00533 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EGFRP00533 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EGFRP00533 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EGFRP00533 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EGFRP00533 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EGFRP00533 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EGFRP00533 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EGFRP00533 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EGFRP00533 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EGFRP00533 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EGFRP00533 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EGFRP00533 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EGFRP00533 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EGFRP00533 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EGFRP00533 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EGFRP00533 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EGFRP00533 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EGFRP00533 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EGFRP00533 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EGFRP00533 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EGFRP00533 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EGFRP00533 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EGFRP00533 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EGFRP00533 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EGFRP00533 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EGFRP00533 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EGFRP00533 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EGFRP00533 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EGFRP00533 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EGFRP00533 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EGFRP00533 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EGFRP00533 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EGFRP00533 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EGFRP00533 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EGFRP00533 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EGFRP00533 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EGFRP00533 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EGFRP00533 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EGFRP00533 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EGFRP00533 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EGFRP00533 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EGFRP00533 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EGFRP00533 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EGFRP00533 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms